La création de la BMS en 2002 était l’expression d’une volonté politique des plus hautes autorités du Mali afin de rendre accessibles les produits et services bancaires aux couches et aux zones les plus défavorisées en utilisant les IMF (Institutions de microfinance) comme levier pour améliorer le niveau de bancarisation du pays et le développement de la microfinance sur l’ensemble du territoire.
Cette création est intervenue dans le contexte d’une plus grande ouverture de l’économie sur l’extérieur en vue d’une meilleure intégration dans l’espace économique régional et mondial. Ce contexte se caractérise aussi par un désengagement progressif de l’État des secteurs productifs en faveur des investisseurs privés ainsi que par une volonté politique de mettre en œuvre la Stratégie Nationale de Lutte contre la Pauvreté (SNLP), dont la création d’une banque de solidarité devait être le socle. La BMS, première du genre au Mali, a été agréée par arrêté ministériel du 09 avril 2002, avec un capital social de 2 305 000 000 de Francs CFA. Depuis, elle a connu diverses augmentations de capital : la dernière en date est celle du 03 mai 2011, pour un montant de 2 492 640 000 de Francs CFA, ce qui porte le montant total du capital social à 10 075 000 000 de Francs CFA.